https://www.nature.com/articles/s41592-026-03124-8 [!abstract]+ 序列到功能（S2F）模型可以评估任意DNA序列，但它们难以全面捕捉个体间基因表达的差异。我们提出了SAGE-net，一个可扩展的框架，用于利用个人基因组训练和评估S2F模型。虽然个人基因组训练提高了对未纳入研究的个体的基因表达预测准确性，但性能提升主要来源于识别预测性变异，而非学习跨位点泛化的顺式调控语法。可扩展的软件对于推进S2F模型在个人基因组学领域的应用至关重要。 github.com GitHub - mostafavilabuw/SAGEnet 通过在 GitHub 上创建帐户来为 mostafavilabuw/SAGEnet 开发做出贡献。 1 个帖子 - 1 位参与者 阅读完整话题
准备用科研经费买个服务器，做生物基因组组装用，对内存容量要求很高，2T起步，是有机房可以托管，但是还是觉得放办公室方便，偏向于塔式，如果放办公室附近那硬盘扩展应该也能方便很多，cpu应该是线程越多越好，看到联想有个平台，不知道咋样，预算不知道能不能压到30万以内，接受任何拆机硬件，只要是新的就行，保修不要求了都 2 个帖子 - 2 位参与者 阅读完整话题
https://www.nature.com/articles/s41586-026-10460-4 靶向插入大片段DNA在基因组工程和基因治疗领域具有广阔的应用前景 1,2 。双引物编辑引导RNA（Twin Prime Editing guide RNA）能够实现相对较大的插入，但对于大于400个碱基对的插入，其效率仍然较低 3,4,5,6 。本文介绍了一种用于插入大片段DNA供体片段的引物组装（PA）方法，该方法设计的片段末端与双引物编辑（twinPE）产生的片段重叠。我们利用PA方法插入了一个或多个重叠的DNA片段，总插入片段大小范围为0.1 kb至11 kb。非同源末端连接（NHEJ）抑制剂提高了插入的效率和精确度。PA方法依赖于易于制备的DNA模板，无需共递送外源DNA依赖性DNA聚合酶，并且可在非增殖细胞中进行，这表明其不依赖于经典的同源定向修复途径。我们的研究表明，PA 可以启动细胞中的 Gibson 样组装，从而产生基因插入，而无需双链 DNA 断裂、重组酶或同源定向修复。 phys.org New genome editing method could swap entire genes and correct 1000 mutations... New technology enables the insertion of a large segment of DNA into a genome, potentially expanding gene therapy treatment from cancellation of disease-causing mutations to replacement of an entire gene, scientists say. https://www.nature.com/articles/s41586-026-10395-w 1 个帖子 - 1 位参与者 阅读完整话题
三星电子周三宣布，将参与美国基因组技术公司Element Biosciences扩大后的E轮融资，向其追加投资1.75亿美元，从而成为该公司最大股东。三星电子在新闻稿中表示，此次投资是继2024年7月参与Element Biosciences的D轮融资后的又一战略加码。三星电子表示，此次投资符合其拓展精准医疗和数字健康技术领域业务的战略目标。（新浪财经）